RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM42Q69YG0 159 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 BRD3OSQ6XYD6 125 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF671Q8TAW3 534 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 AQP3Q92482 292 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 RNFT2Q96EX2 444 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 DUX5Q96PT3 197 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 NLKQ9UBE8 527 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1B0GVI7 797 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BSH0 61 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP9P14780 707 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL1P22362 96 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 BAMBIQ13145 260 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 OCLNQ16625 522 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 TP53I3Q53FA7 332 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR157Q5UAW9 335 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZSR3 168 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 WDFY2Q96P53 400 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 TBX15Q96SF7 602 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC29A1Q99808 456 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 SIRPDQ9H106 197 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 DNTTIP1Q9H147 329 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 AASSQ9UDR5 926 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 GNG8Q9UK08 70 aa16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2AT4A6NND4 320 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 DLGAP1O14490 977 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ARF6P62330 175 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTC1P68032 377 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTA1P68133 377 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 GAFA1Q96PS6 74 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ACOXLQ9NUZ1 547 aa16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 SYT7O43581 403 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 BAG2O95816 211 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 PRTN3P24158 256 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 HAAOP46952 286 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRA2P47869 451 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ISL1P61371 349 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 IL13RA1P78552 427 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 DGUOKQ16854 277 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF573Q86YE8 665 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 MED30Q96HR3 178 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 ADI1Q9BV57 179 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39-201ENST00000393537 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 DAPL1A0PJW8 107 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM89A2RUT3 159 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD61A6NGH8 418 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 SNTNA6NMZ2 147 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 J3QT63 122 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR37O15354 613 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNGR1O43759 233 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 PSG2P11465 335 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRB1P18505 474 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 KIR3DL2P43630 455 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 LY6G5BQ8NDX9 201 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF488Q96MN9 340 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 DCTN5Q9BTE1 182 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ONECUT1Q9UBC0 465 aa16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 J3QRE1 110 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 HAX1O00165 279 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 SIGLEC5O15389 551 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFB7P17568 137 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 BPIFB3P59826 476 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCD1Q15116 288 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 CDONQ4KMG0 1287 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ACP7Q6ZNF0 438 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 POC1AQ8NBT0 407 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 LHX4Q969G2 390 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 LGALS12Q96DT0 336 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 RASL12Q9NYN1 266 aa16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF222Q9UK12 451 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms