RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OMDQ99983 421 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PGAP2Q9UHJ9 254 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HEY1Q9Y5J3 304 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAPPC13A5PLN9 417 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STARD3NLO95772 234 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MLNP12872 115 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GNRHRP30968 328 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DEFB109BQ30KR1 87 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HHATQ5VTY9 493 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ECHDC2Q86YB7 292 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRR15Q8IV56 129 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SLC35F2Q8IXU6 374 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TEKT1Q969V4 418 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CPB2Q96IY4 423 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HSFY1Q96LI6 401 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SAMD8Q96LT4 415 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAD2L2Q9UI95 211 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM72A0PK05 275 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SH2D1AO60880 128 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AP2A1O95782 977 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TNFP01375 233 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FGF1P05230 155 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPNP16150 400 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HTR4Q13639 388 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MPP7Q5T2T1 576 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARL10Q8N8L6 244 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C9orf163Q8N9P6 203 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MINDY2Q8NBR6 621 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RXFP4Q8TDU9 374 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IMUPQ9GZP8 106 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SIRPDQ9H106 197 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ANKHQ9HCJ1 492 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PSMD13Q9UNM6 376 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 COL18A1P39060 1754 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A1B0GWJ7 208 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 F5H5P2 479 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CIAO1O76071 339 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CDK1P06493 297 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TEAD1P28347 426 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ETV1P50549 477 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MESDQ14696 234 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DCAKDQ8WVC6 231 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CDS1Q92903 461 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BORCS5Q969J3 196 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FTHL17Q9BXU8 183 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IL36GQ9NZH8 169 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AKAP9Q99996 3911 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LRP5LA4QPB2 252 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LGALS8O00214 317 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBE2CO00762 179 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRT34O76011 436 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FGF4P08620 206 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FOXN2P32314 431 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RHBDL3P58872 404 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IFITM3Q01628 133 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GLO1Q04760 184 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C4orf26Q17RF5 130 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM229BQ4G0N7 80 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC01620Q4KN68 170 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR6B2Q6IFH4 312 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC121Q6ZUS5 278 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VMO1Q7Z5L0 202 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZDHHC22Q8N966 263 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM185BQ9H7F4 350 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MCM3APO60318 1980 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATP5LO75964 103 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EPB41P11171 864 aaKnown RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CRABP1P29762 137 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MOGQ16653 247 aa-3.67□□□□□ -3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms