RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 FAIM2Q9BWQ8 316 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TAPBPLQ9BX59 468 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR51M1Q9H341 326 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IL36RNQ9UBH0 155 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CD84Q9UIB8 345 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC4EQ9ULY5 219 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PLCE1Q9P212 2302 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GW54 56 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 A6NDN8 102 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR5K3A6NET4 321 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01549A6NIU2 74 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 K7ERU9 68 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM23O14925 209 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 BET1O15155 118 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TBL1XO60907 577 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UGT2B11O75310 529 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CDK1P06493 297 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CD48P09326 243 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MYOGP15173 224 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PRPS1L1P21108 318 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACRV1P26436 265 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IVDP26440 423 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CD82P27701 267 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ID1P41134 155 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 VEGFCP49767 419 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RORCP51449 518 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-16P61578 105 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ARF6P62330 175 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PDK2Q15119 407 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GPRC6AQ5T6X5 926 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TRNP1Q6NT89 227 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TAC4Q86UU9 113 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TTLQ8NG68 377 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR2AP1Q8NGE2 309 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR52L1Q8NGH7 329 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR13C4Q8NGS5 318 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR4K13Q8NH42 304 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 Q8TCH9 128 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP90Q8TF47 636 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SCARB1Q8WTV0 552 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM80Q96HE8 168 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf77Q96MU5 243 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 STACQ99469 402 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RNF2Q99496 336 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRL4Q9HBW9 690 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ENY2Q9NPA8 101 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 B3GNT2Q9NY97 397 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GPR83Q9NYM4 423 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GNG12Q9UBI6 72 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL2Q9UKC9 423 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SPTBP11277 2137 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UNC119BA6NIH7 251 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 VSTM2BA6NLU5 285 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 F6UZH7 168 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 F8W036 122 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 B4GAT1O43505 415 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ENTPD6O75354 484 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ATG12O94817 140 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CYB5AP00167 134 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HBE1P02100 147 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PRH1P02810 166 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OPN1SWP03999 348 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CD5P06127 495 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR56A5P0C7T3 313 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF286BP0CG31 522 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FAM157CP0CG43 387 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR5H8P0DN80 308 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF1BP20333 461 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TACR3P29371 465 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MIPP30301 263 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCKARP32238 428 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IFNGR2P38484 337 aa2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RPL5P46777 297 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NPBWR2P48146 333 aa2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms