RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.12■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 NSG2Q9Y328 171 aa16.12■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PGA4P0DJD7 388 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PGA3P0DJD8 388 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PRF1P14222 555 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SERPINA2P20848 420 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 FBXW4P57775 412 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 MFAP5Q13361 173 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RTL6Q6ICC9 239 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 IGHV2-70P01814 119 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 OR2B8PP59922 312 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RNF4P78317 190 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PPA1Q15181 289 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 C19orf12Q9NSK7 152 aa16.11■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SHISA8B8ZZ34 492 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 CA11O75493 328 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ARG1P05089 322 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 S100A13Q99584 98 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 GINS3Q9BRX5 216 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PBDC1Q9BVG4 233 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PADI1Q9ULC6 663 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 STMND1H3BQB6 276 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 P2RY1P47900 373 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 FHITP49789 147 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RAB5CP51148 216 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SLC35A1P78382 337 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 MYBPHQ13203 477 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 LMX1AQ8TE12 382 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 TM2D1Q9BX74 207 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa16.1■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 MBPP02686 304 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PRH1P02810 166 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 FOSL2P15408 326 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ARL4DP49703 201 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1W2PPE2 198 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 MASP2O00187 686 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 RAB1AP62820 205 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 GRB2P62993 217 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ACER2Q5QJU3 275 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 CARD17Q5XLA6 110 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 OR1L3Q8NH93 324 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 DECR2Q9NUI1 292 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1W2PPC4 97 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 IFNA17P01571 189 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 GPR157Q5UAW9 335 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 C1orf189Q5VU69 101 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 HIST2H3AQ71DI3 136 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM156Q8N614 296 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 GNRHR2Q96P88 292 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 WFDC1Q9HC57 220 aa16.08■□□□□ 0.17
LRRC25-201ENST00000339007 GPR137BO60478 399 aa16.08■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 C1QL4Q86Z23 238 aa16.08■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 PGAM5Q96HS1 289 aa16.08■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.08■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16.08■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 MYO9BQ13459 2157 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 EFNA2O43921 213 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 C1QL1O75973 258 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 PIGPP57054 158 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 E9PLN8 166 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRRC25-201ENST00000339007 FBP1P09467 338 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms