RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TVP23CQ96ET8 276 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYYR1Q96J86 154 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H0YL77 283 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NSA2O95478 260 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR5AS1Q8N127 324 aa19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR14C36Q8NHC7 312 aa19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARID1AO14497 2285 aa19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC31A1O15431 190 aa19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RND3P61587 244 aa19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1456Q9P272 454 aa19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A1W2PP11 408 aa19.98■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR5H8P0DN80 308 aa19.98■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM89BQ8N5H3 189 aa19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR14K1Q8NGZ2 314 aa19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PITPNC1Q9UKF7 332 aa19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPIPB7O75200 414 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTSBP07858 339 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HCKP08631 526 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF664Q8N3J9 261 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLAMF6Q96DU3 332 aa19.97■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTN4RQ9BZR6 473 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 METTL9Q9H1A3 318 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTCH2Q9Y6C9 303 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 QDPRP09417 244 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FMODQ06828 376 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL13RA2Q14627 380 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HRASLS2Q9NWW9 162 aa19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNFRSF9Q07011 255 aa19.96■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR51T1Q8NGJ9 327 aa19.96■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa19.96■□□□□ 0.79
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUDT14O95848 222 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf87Q8N0U7 546 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF248Q8NDW4 579 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR51E1Q8TCB6 317 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADOQ96SZ5 270 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DECR2Q9NUI1 292 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LTBP2Q14767 1821 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A087WZY1 265 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PGCP20142 388 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RND2P52198 227 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ICAM4Q14773 271 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB110Q30KQ9 67 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF506Q5JVG8 444 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9orf40Q8IXQ3 194 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STT3BQ8TCJ2 826 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHDQ96IW2 340 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDA1Q9BW61 102 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM60AQ9NP50 221 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM131Q92545 1883 aa19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP8O43159 456 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XRCC2O43543 280 aa19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WISP1O95388 367 aa19.94■□□□□ 0.78
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