RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 TGP01266 2768 aa16.02■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ACOD1A6NK06 481 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 AQP12BA6NM10 295 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 H0YAE9 185 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 HCP5Q6MZN7 132 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MOB3CQ70IA8 216 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 COMMD2Q86X83 199 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM185AQ8N0U4 392 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR5A2Q8NGI9 324 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR5D13Q8NGL4 314 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 AQP3Q92482 292 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 THTPAQ9BU02 230 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TEX12Q9BXU0 123 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 YY1AP1Q9H869 796 aa16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR5B21A6NL26 309 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 H3BUX3 64 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ANXA8P13928 327 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V1B1P15313 513 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf68Q2NKX9 166 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 DEGS2Q6QHC5 323 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR51E1Q8TCB6 317 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 C17orf50Q8WW18 174 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ITFG2Q969R8 447 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SDSLQ96GA7 329 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SSX3Q99909 188 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MROQ9BYG7 248 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PBOV1Q9GZY1 135 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf21Q9H246 121 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A19Q9HC21 320 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 GPR84Q9NQS5 396 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 FBLN5Q9UBX5 448 aa16■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 GSC2O15499 205 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ANGPTL7O43827 346 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAHP16930 419 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CAPZA1P52907 286 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 C1QL4Q86Z23 238 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TEAD3Q99594 435 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 RASL12Q9NYN1 266 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.99■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 NOTCH1P46531 2555 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0G2JK05 382 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PRR32B1ATL7 298 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF254O75437 659 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 IGLV3-1P01715 115 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 GABRA5P31644 462 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SNAPC1Q16533 368 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 LY6EQ16553 131 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ACP7Q6ZNF0 438 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 RORBQ92753 470 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 AJUBAQ96IF1 538 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR8B4Q96RC9 309 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ENPP5Q9UJA9 477 aa15.98■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC182A6NF36 153 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 NRASP01111 189 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CSF1P09603 554 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CBX1P83916 185 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ROM1Q03395 351 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MKXQ8IYA7 352 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CD177Q8N6Q3 437 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 POC1AQ8NBT0 407 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R35Q8TAP8 253 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF488Q96MN9 340 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 COPS3Q9UNS2 423 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.97■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SYNGR1O43759 233 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 DHRS3O75911 302 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM107AO95990 144 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 PAX6P26367 422 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 RIDAP52758 137 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms