RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc2a9Q3T9X0 538 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Usp22Q5DU02 525 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sp9Q64HY3 484 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igsf21Q7TNR6 468 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp748Q7TPL6 888 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10600Q8BQ57 223 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chrnb4Q8R493 495 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930412O13RikQ9D5M9 106 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dmac2Q9D7K5 258 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chst1Q9EQC0 411 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 B3GNT2Q9Z222 397 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrit3W8DXL4 681 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Shisa8J3QNX5 399 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GusbP12265 648 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 H2-T3P14432 384 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gbx1P82976 418 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pitx2P97474 317 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam187bQ0VAY3 358 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Malt1Q2TBA3 832 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc25a26Q5U680 274 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CybaQ61462 192 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr314Q7TRZ7 330 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem198bQ8CFU0 350 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CcnqQ8QZR8 250 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb35Q8R2I3 63 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ear6Q923L7 155 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Snapc3Q9D2C9 407 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tex43Q9D9I1 141 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r44Q9EQ47 310 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ammecr1Q9JHT5 344 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trem1Q9JKE2 230 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr122W4VSP0 330 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-42A0A0A6YY38 117 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10358A0A1D5RLD8 333 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GapdhP16858 333 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 B4galnt1Q09200 533 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dmrtc1bQ2PMX6 267 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Osbp2Q5QNQ6 908 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kiaa1456Q80WQ4 447 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r237Q8R296 289 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr777Q8VFH3 311 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr734Q8VFT4 313 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gbgt1Q8VI38 347 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Plrg1Q922V4 513 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Otud1Q9CUB6 454 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mlf1Q9QWV4 267 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3839S4R1W1 333 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1247A2AT78 314 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lin7cO88952 197 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 IghgP01863 330 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ly6aP05533 134 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Agbl4Q09LZ8 540 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam189a1Q6A044 515 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnf24Q8BGI1 148 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc5a7Q8BGY9 580 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prss35Q8C0F9 409 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NotumQ8R116 503 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1449Q8VEV8 314 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Maf1Q9D0U6 258 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dda1Q9D9Z5 102 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo8Q9QZN3 319 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Shank3Q4ACU6 1730 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps16P14131 146 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CtsaP16675 474 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gdf7P43029 461 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dio1Q61153 257 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DhhQ61488 396 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fxyd3Q61835 88 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr988Q7TRA1 309 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr775Q7TRI4 312 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SergefQ80YD6 464 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nsun3Q8CCT7 348 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmprss3Q8K1T0 453 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrgpra3Q91WW3 302 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl24Q9CQ06 216 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl8a9Q9CQ58 241 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cpn1Q9JJN5 457 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Exo1Q9QZ11 837 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5678A0A1B0GRG8 277 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnf165E9QAU8 347 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Onecut1O08755 465 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AF067061O70616 171 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chrnb1P09690 501 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prkar2aP12367 401 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hist1h1cP15864 212 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp1caP62137 330 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gfi1P70338 423 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stk35Q80ZW0 539 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem127Q8BGP5 238 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf8Q8BGV5 572 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lax1Q8BHB3 407 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Poc1bQ8BHD1 476 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms