RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 ARL6IP5O75915 188 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 RCBTB2O95199 551 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 HAND1O96004 215 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 IGLV1-40P01703 118 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 IGHG4P01861 327 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TYMSP04818 313 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 HLA-DQB2P05538 268 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CTSLP07711 333 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CXCL1P09341 107 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PGA4P0DJD7 388 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PGA5P0DJD9 388 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CD99P14209 185 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CD34P28906 385 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 GZMMP51124 257 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PDX1P52945 283 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TAS2R50P59544 299 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ADAM8P78325 824 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CDC42EP1Q00587 391 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC6A3Q01959 620 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 DHRS2Q13268 280 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 RGNQ15493 299 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 MMDQ15546 238 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CCL15Q16663 113 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 LINC00303Q3SY05 128 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PHF19Q5T6S3 580 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 C12orf73Q69YU5 71 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OPN5Q6U736 354 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 Q6ZN92 141 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 FA2HQ7L5A8 372 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 LAS2Q8IYD9 372 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC5A8Q8N695 610 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OR4X1Q8NH49 305 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OR10C1Q96KK4 312 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 NMES1Q9C002 83 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ALG9Q9H6U8 611 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SCML2Q9UQR0 700 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 FUT9Q9Y231 359 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 RAXQ9Y2V3 346 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 YIPF1Q9Y548 306 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PATJQ8NI35 1801 aa5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 IGLON5A6NGN9 336 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC22A20A6NK97 555 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 E5RGE8 158 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 H7BYZ3 331 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 FFAR2O15552 330 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 FCMRO60667 390 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SEC11BP0C7V7 166 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 LINC00032P0C843 101 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ERGP11308 486 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PSG1P11464 419 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 LYL1P12980 280 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 AREGP15514 252 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 SDHBP21912 280 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 ATP6V0CP27449 155 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 HTR1FP30939 366 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 PRLHRP49683 370 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 GPM6AP51674 278 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 EGR4Q05215 589 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 HSD52Q0P140 79 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 OLIG2Q13516 323 aa5.49□□□□□ -1.53
SAMMSON-210ENST00000641260 TGIF1Q15583 401 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms