RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CEACAM16Q2WEN9 425 aa19.14■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 ARRDC1Q8N5I2 433 aa19.14■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 POM121Q96HA1 1249 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00052Q96N35 136 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-211ENST00000580170 FUT3P21217 361 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRM-211ENST00000580170 LEUTXA8MZ59 168 aa19.1■□□□□ 0.65
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