RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA2	P20848	420 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SSR4	P51571	173 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	AQP10	Q96PS8	301 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OR5H15	A6NDH6	313 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GJE1	A6NN92	205 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	YKT6	O15498	198 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ADAP1	O75689	374 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-B	Q31612	363 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ATRAID	Q6UW56	229 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GNRHR2	Q96P88	292 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PRELID1	Q9Y255	219 aa		16.14	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559		C9J4A7	227 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559		H0YIZ8	118 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	DNPH1	O43598	174 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HTR3B	O95264	441 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PI3	P19957	117 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	STK11	Q15831	433 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC18	Q8N456	261 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ARL11	Q969Q4	196 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf63	A6NC05	138 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZIC3	O60481	467 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CD63	P08962	238 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CCL3	P10147	92 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CD79A	P11912	226 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	COX6A1	P12074	109 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GLRA1	P23415	457 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RAC1	P63000	192 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	FAM27B	Q5VT28	67 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	DRAM2	Q6UX65	266 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SPSB1	Q96BD6	273 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	NTNG2	Q96CW9	530 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	EDAR	Q9UNE0	448 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		16.13	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM218	A2RU14	115 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	KCNAB3	O43448	404 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CBR3	O75828	277 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ATG12	O94817	140 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	UMOD	P07911	640 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM156	Q8N614	296 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IFI44	Q8TCB0	444 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MR1	Q95460	341 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-C	Q95604	372 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR5	O14804	337 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA2	P01563	188 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CELA2A	P08217	269 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SVBP	Q8N300	66 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	POC1A	Q8NBT0	407 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	UCN2	Q96RP3	112 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PROK2	Q9HC23	129 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		16.12	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	16.11	■□□□□ 0.17

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