RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PLCE1	Q9P212	2302 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GVI7	797 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		A6NLC8	198 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	INAFM1	C9JVW0	142 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC1A7	O00341	560 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	INMT	O95050	263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	NRAS	P01111	189 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TGFA	P01135	160 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	LHB	P01229	141 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	HEXA	P06865	529 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CHN2	P52757	468 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	BTG1	P62324	171 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ACTA2	P62736	377 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ACTG2	P63267	376 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM42	Q69YG0	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	WDR82	Q6UXN9	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		Q6ZSR3	168 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	KRT74	Q7RTS7	529 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FGFRL1	Q8N441	504 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	STX19	Q8N4C7	294 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		Q8TCH9	128 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MICU1	Q9BPX6	476 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC22A4	Q9H015	551 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	OR51I2	Q9H344	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ACAN	P16112	2415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZAN	Q9Y493	2812 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GW55	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PPIAL4D	F5H284	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	AKR7A2	O43488	359 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PLPP2	O43688	288 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SYNGR1	O43759	233 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CD5L	O43866	347 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FCN3	O75636	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	IGHV2-5	P01817	119 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ISG15	P05161	165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CDK1	P06493	297 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MYL12A	P19105	171 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	AMY2B	P19961	511 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MAP2K4	P45985	399 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SOX2	P48431	317 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CCR9	P51686	369 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CDH15	P55291	814 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC3A1	Q07837	685 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	INSL4	Q14641	139 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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