RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		Q9UFV3	132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0G2JK05	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GUH1	482 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ISPD	A4D126	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A6NIN4	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CENPX	A8MT69	81 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A8MXE2	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		M0R1B8	84 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LMX1B	O60663	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TPPP	O94811	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	KDM4B	O94953	1096 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PAH	P00439	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ADRA2C	P18825	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ELK1	P19419	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CHRNB4	P30926	498 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MNDA	P41218	407 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CA7	P43166	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RBP2	P50120	134 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF83	P51522	516 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FUT6	P51993	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	UCP2	P55851	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CLDN12	P56749	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SELENOV	P59797	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PPP1CB	P62140	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAM3A	P98173	230 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF92	Q03936	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SCN1B	Q07699	218 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GPR176	Q14439	515 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RSU1	Q15404	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		Q8N402	240 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PIGT	Q969N2	578 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PTX4	Q96A99	478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CST11	Q9H112	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SPEG	Q15772	3267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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