RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	MED20	Q9H944	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CA10	Q9NS85	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A0U1RQV5	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1W2PR80	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		M0R135	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HS3ST1	O14792	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	XRCC2	O43543	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	KRT8	P05787	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ADH4	P08319	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DANCR	P0C864	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	LYL1	P12980	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SELE	P16581	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF12	P17014	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HSD11B1	P28845	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	MC5R	P33032	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	OPRL1	P41146	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	GATA4	P43694	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HTR5A	P47898	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF273	Q14593	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TAF13	Q15543	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		Q6ZSR3	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1W2PRX2	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		E7EQL1	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		F5H5K5	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459		F5H697	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	OVOL3	O00110	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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