RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACOXLQ9NUZ1 547 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KAAG1Q9UBP8 84 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OPN4Q9UHM6 478 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 METRNQ9UJH8 293 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNG8Q9UK08 70 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC22A13Q9Y226 551 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LOC105371242A0A075B767 164 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DAPL1A0PJW8 107 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 P2RY10O00398 339 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FSHBP01225 129 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB40BQ12829 278 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR38Q5JTN6 314 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLVS2Q5SYC1 327 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LPCAT4Q643R3 524 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FDX2Q6P4F2 183 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCTD8Q6ZWB6 473 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACBD7Q8N6N7 88 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCCPDHQ8NBX0 429 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NANPQ8TBE9 248 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LGALS12Q96DT0 336 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRI1Q9BV20 369 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CTSZQ9UBR2 303 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1B0GVI7 797 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF732B4DXR9 585 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NRASP01111 189 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHA1P01876 353 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PEX2P28328 305 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPM6AP51674 278 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MICBQ29980 383 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TP53I3Q53FA7 332 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP78Q5JTW2 689 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLCXD3Q63HM9 321 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APH1BQ8WW43 257 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C10orf35Q96D05 121 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR51I2Q9H344 312 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AASSQ9UDR5 926 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AUP1Q9Y679 476 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATRQ13535 2644 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A0A6YYJ9 748 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAM20O43506 726 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYT7O43581 403 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TCF21O43680 179 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FADS2O95864 444 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GYPAP02724 150 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAX8Q06710 450 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GALEQ14376 348 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF691Q5VV52 312 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTC23Q5W5X9 447 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MOB3CQ70IA8 216 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYS1Q8N2H4 156 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TECTBQ96PL2 329 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ENSAO43768 121 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ISG15P05161 165 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADRA2CP18825 462 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPHA1P21709 976 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIR3DL2P43630 455 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCR9P51686 369 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL18R1Q13478 541 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC36Q1X8D7 754 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KLHL22Q53GT1 634 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARMCX4Q5H9R4 360 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM244Q5VVB8 128 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD276Q5ZPR3 534 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STUMQ69YW2 141 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SETD9Q8NE22 299 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR2G2Q8NGZ5 317 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AQP3Q92482 292 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C4orf36Q96KX1 117 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADI1Q9BV57 179 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALG8Q9BVK2 526 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 JAM3Q9BX67 310 aa13.45□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa13.44□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms