RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 PIGCQ92535 297 aa15.65■□□□□ 0.1
PUF60-218ENST00000531995 ITPKCQ96DU7 683 aa15.65■□□□□ 0.1
PUF60-218ENST00000531995 Q9H521 79 aa15.65■□□□□ 0.1
PUF60-218ENST00000531995 GCM1Q9NP62 436 aa15.65■□□□□ 0.1
PUF60-218ENST00000531995 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
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PUF60-218ENST00000531995 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.64■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.64■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ACHEP22303 614 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 GATA4P43694 442 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 MED21Q13503 144 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 CDK5R1Q15078 307 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 MPPED2Q15777 294 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 CCDC58Q4VC31 144 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.64■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.63■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.63■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.63■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 CCL17Q92583 94 aa15.63■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 OR5M11Q96RB7 305 aa15.63■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ENPP5Q9UJA9 477 aa15.63■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 TNFRSF1AP19438 455 aa15.62■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 TMEM33P57088 247 aa15.62■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.62■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.62■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.62■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 TMEM212A6NML5 194 aa15.61■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 MAP2K4P45985 399 aa15.61■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 CEACAM21Q3KPI0 293 aa15.61■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.61■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 FTMTQ8N4E7 242 aa15.6■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 OR8S1Q8NH09 359 aa15.6■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 GHSRQ92847 366 aa15.6■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 C10orf35Q96D05 121 aa15.6■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 SMIM19Q96E16 107 aa15.6■□□□□ 0.09
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PUF60-218ENST00000531995 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.6■□□□□ 0.09
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