RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.55□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ZNF292O60281 2723 aa14.55□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 OR14I1A6ND48 311 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 TSC22D2O75157 780 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 FAM3AP98173 230 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 CCDC107Q8WV48 283 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 C12orf49Q9H741 205 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 MFNGO00587 321 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PLATP00750 562 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 EDN3P14138 238 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ARFRP1Q13795 201 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 STK11Q15831 433 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PRSS33Q8NF86 280 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 G3V3Q6 166 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ZNHIT1O43257 154 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 NRASP01111 189 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PMP2P02689 132 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 OR4E1P0C645 316 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 CD79AP11912 226 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PRKACBP22694 351 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 OR4K15Q8NH41 348 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 SNAPC3Q92966 411 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 XRCC2O43543 280 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ANGPTL7O43827 346 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 IFNA6P05013 189 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 CCL2P13500 99 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 BORCS8Q96FH0 119 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.53□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A20A6NK97 555 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 SIX6O95475 246 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 RBP2P50120 134 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 PRSS50Q9UI38 385 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 VSIG4Q9Y279 399 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.52□□□□□ -0.08
TOM1-216ENST00000492723 C5orf49A4QMS7 147 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 GOSR2O14653 212 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TBPP20226 339 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 S100A1P23297 94 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CPT2P23786 658 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 RAP2BP61225 183 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 RSU1Q15404 277 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TMEM42Q69YG0 159 aa14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR2A4O95047 310 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 GABRR1P24046 479 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MPZP25189 248 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR8B8Q15620 311 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 NAXEQ8NCW5 288 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PIGCQ92535 297 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OR2A7Q96R45 310 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TM2D1Q9BX74 207 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 METTL9Q9H1A3 318 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 HTR3BO95264 441 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 AGTR1P30556 359 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 H2BFSP57053 126 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 ZMYND11Q15326 602 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 MICBQ29980 383 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 C11orf88Q6PI97 169 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 FBXW5Q969U6 566 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 GPR137Q96N19 417 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PECRQ9BY49 303 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.51□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 TSPAN5P62079 268 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 RAB1AP62820 205 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 CAMK2BQ13554 666 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-216ENST00000492723 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms