RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 COMMD2Q86X83 199 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SHISA5Q8N114 240 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HMGB4Q8WW32 186 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AQP3Q92482 292 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DDIT4LQ96D03 193 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SEC22AQ96IW7 307 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC35E1Q96K37 410 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 P2RX4Q99571 388 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GPR174Q9BXC1 333 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RBKSQ9H477 322 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 POT1Q9NUX5 634 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NOTCH4Q99466 2003 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 H0YIZ8 118 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 K7ERU9 68 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HSD17B6O14756 317 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LDLRAD4O15165 306 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HCRTO43612 131 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TCF21O43680 179 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TNFSF15O95150 251 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CATP04040 527 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TYMSP04818 313 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IFNA6P05013 189 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CLEC3BP05452 202 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CXCL1P09341 107 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CTXN2P0C2S0 81 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TACR2P21452 398 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MSR1P21757 451 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC6A6P31641 620 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR1D2P34982 312 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CAMLGP49069 296 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RAB7AP51149 207 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PTTG1IPP53801 180 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 UCP3P55916 312 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MTCP1P56278 107 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC37A1P57057 533 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R50P59544 299 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ERVFRD-1P60508 538 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DRB3P79483 266 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FBXL22Q6P050 247 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 Q7L0L9 218 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HOGA1Q86XE5 327 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NRMQ8IXM6 262 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 D2HGDHQ8N465 521 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EXD3Q8N9H8 876 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 POC1AQ8NBT0 407 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF738Q8NE65 137 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NUDT11Q96G61 164 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GUCD1Q96NT3 240 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TP53RKQ96S44 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CST11Q9H112 138 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.34□□□□□ -1.39
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