RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 J3QLI3 93 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 IFNA2P01563 188 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 IGHA1P01876 353 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 GATA3P23771 443 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 GPM6AP51674 278 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ZNF841Q6ZN19 808 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 KCTD8Q6ZWB6 473 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 DHRSXQ8N5I4 330 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 SCCPDHQ8NBX0 429 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 OR5A2Q8NGI9 324 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 OR10Z1Q8NGY1 313 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 CUBNO60494 3623 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 DHRS7CA6NNS2 312 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ZNF732B4DXR9 585 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
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ACTB-211ENST00000480301 SRP14P37108 136 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
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ACTB-211ENST00000480301 PAX2Q02962 417 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 GALEQ14376 348 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ8Q15842 424 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 CLVS2Q5SYC1 327 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 PLCXD3Q63HM9 321 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 FDX2Q6P4F2 183 aa17.47■□□□□ 0.39
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ACTB-211ENST00000480301 OR2G2Q8NGZ5 317 aa17.47■□□□□ 0.39
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ACTB-211ENST00000480301 OR51I2Q9H344 312 aa17.47■□□□□ 0.39
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ACTB-211ENST00000480301 GPR173Q9NS66 373 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 OPN4Q9UHM6 478 aa17.47■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVI7 797 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 A6NIN4 97 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 SRRM5B3KS81 715 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 H3BSH0 61 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 J3QLW9 94 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 SYT7O43581 403 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ZNF12P17014 697 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ZNF19P17023 458 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 GNB2P62879 340 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 KLHL22Q53GT1 634 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 NLRC3Q7RTR2 1065 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 RDH10Q8IZV5 341 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 CNIH3Q8TBE1 160 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 SEH1LQ96EE3 360 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 PELI1Q96FA3 418 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 C4orf36Q96KX1 117 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ADI1Q9BV57 179 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ALG8Q9BVK2 526 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 C7orf69Q9H7B7 122 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 INPP5EQ9NRR6 644 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 CTSZQ9UBR2 303 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 INSIG2Q9Y5U4 225 aa17.46■□□□□ 0.39
ACTB-211ENST00000480301 LOC105371242A0A075B767 164 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 OR5B21A6NL26 309 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA2O43678 99 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 GYPAP02724 150 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ACTA2P62736 377 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ACTG2P63267 376 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 EGFL6Q8IUX8 553 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 SYS1Q8N2H4 156 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 CCDC54Q8NEL0 328 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 FRRS1LQ9P0K9 344 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 CLN8Q9UBY8 286 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 OR5V1Q9UGF6 321 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ADAM20O43506 726 aa17.44■□□□□ 0.38
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ACTB-211ENST00000480301 HTR1AP08908 422 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 CAPGP40121 348 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 SLC34A1Q06495 639 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 MICBQ29980 383 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 SETD9Q8NE22 299 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 AQP3Q92482 292 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 WDR13Q9H1Z4 485 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 KAAG1Q9UBP8 84 aa17.44■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 H0YAE9 185 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 AKR7A2O43488 359 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 FCN3O75636 299 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ADRA2CP18825 462 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 CCR9P51686 369 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 PAX8Q06710 450 aa17.43■□□□□ 0.38
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