RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CX3CR1P49238 355 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ERFP50548 548 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF92Q03936 586 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RFKQ969G6 155 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 WDFY2Q96P53 400 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CIB1Q99828 191 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MROQ9BYG7 248 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SIRPDQ9H106 197 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MED20Q9H944 212 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.31□□□□□ -1.4
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RBBP4-211ENST00000477563 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.31□□□□□ -1.4
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RBBP4-211ENST00000477563 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.31□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFA2O43678 99 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PRKYO43930 277 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF205O95201 554 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 IGLV3-1P01715 115 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV4-59P01825 116 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CSF1P09603 554 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ALDH3A2P51648 485 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PRKXP51817 358 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CDC42P60953 191 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FAM3AP98173 230 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 IL5RAQ01344 420 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 EGR3Q06889 387 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MAB21L1Q13394 359 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 APOFQ13790 326 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR8G1Q15617 311 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TIGD6Q17RP2 521 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 KLHL12Q53G59 568 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OTPQ5XKR4 325 aa6.3□□□□□ -1.4
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RBBP4-211ENST00000477563 Q6ZSR3 168 aa6.3□□□□□ -1.4
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RBBP4-211ENST00000477563 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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RBBP4-211ENST00000477563 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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RBBP4-211ENST00000477563 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 REEP6Q96HR9 211 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RDH12Q96NR8 316 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR8B4Q96RC9 309 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 C8orf4Q9NR00 106 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CLN6Q9NWW5 311 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CTSZQ9UBR2 303 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LRP12Q9Y561 859 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.3□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 A0A0U1RQK1 487 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 GGT3PA6NGU5 568 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM210A6NLX4 147 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SNTNA6NMZ2 147 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 H3BNX3 289 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SELENOFO60613 162 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FCN3O75636 299 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SULT1C4O75897 302 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CST4P01036 141 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR2T7P0C7T2 308 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 IRF2P14316 349 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 HTR1FP30939 366 aa6.29□□□□□ -1.4
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