RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CA6P23280 308 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OPRL1P41146 370 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ETV1P50549 477 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 SP140LQ9H930 580 aa9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 J3QRE1 110 aa9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 COMMD2Q86X83 199 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OR10A2Q9H208 303 aa9.75□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 SRRM5B3KS81 715 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PHYHO14832 338 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF205O95201 554 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PLATP00750 562 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 LIMS3P0CW19 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 LIMS4P0CW20 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 IRF2P14316 349 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MMP16P51512 607 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 RAG2P55895 527 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZMYND11Q15326 602 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 GPR157Q5UAW9 335 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MNTQ99583 582 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MND1Q9BWT6 205 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 OPA3Q9H6K4 179 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 GCM1Q9NP62 436 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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