RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439673.6

TSC2-207, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TSC2, Length 5,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-207ENST00000439673 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.61□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.61□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 J3QR89 54 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 SLC6A1P30531 599 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 RAB40CQ96S21 281 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TTC3P53804 2025 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PHOX2AO14813 284 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PTHLHP12272 177 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 HNF1AP20823 631 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TPPP2P59282 170 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PPP1CBP62140 327 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TRIB1Q96RU8 372 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 GPR37O15354 613 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 HEXAP06865 529 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ZPBPQ9BS86 351 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 C9orf170A2RU37 121 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 METTL12A8MUP2 240 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 MPC2O95563 127 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ZNF17P17021 662 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 GNG3P63215 75 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 RASL12Q9NYN1 266 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 DHRS3O75911 302 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PTGFRP43088 359 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 INSL4Q14641 139 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 LRRC61Q9BV99 259 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 SLC22A20A6NK97 555 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 MVDP53602 400 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 GNB4Q9HAV0 340 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 BTAF1O14981 1849 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 CLDN34H7C241 214 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 CTDSPLO15194 276 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 CLDN23Q96B33 292 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ALG14Q96F25 216 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ABHD1Q96SE0 405 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 MYO7AQ13402 2215 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 OR2W5A6NFC9 320 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ST8SIA5O15466 376 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 GPANK1O95872 356 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 HPP00738 406 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 GNB1P62873 340 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.59□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 DBX1A6NMT0 343 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ALG1L2C9J202 215 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 TCTN1Q2MV58 587 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ZG16BQ96DA0 208 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 OR2A5Q96R48 311 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 UCK1Q9HA47 277 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.58□□□□□ -0.07
TSC2-207ENST00000439673 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 COX7A2P2O60397 106 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 ZNF141Q15928 474 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 SP6Q3SY56 376 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 TAF1P21675 1872 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 F2RP25116 425 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 AMER3Q8N944 861 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.58□□□□□ -0.08
TSC2-207ENST00000439673 CTSVO60911 334 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms