RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	DAPL1	A0PJW8	107 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR32	B1ATL7	298 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF879	B4DU55	563 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	KCNAB3	O43448	404 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TOX4	O94842	621 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	KNG1	P01042	644 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2T7	P0C7T2	308 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	CXCR4	P61073	352 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ACTC1	P68032	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ACTA1	P68133	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	OR8B8	Q15620	311 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MPPED2	Q15777	294 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	AHSA2	Q719I0	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	NAA40	Q86UY6	237 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2T27	Q8NH04	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	OOEP	A6NGQ2	149 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	C22orf46	C9J442	243 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ADAM20	O43506	726 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	CFHR2	P36980	270 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	RAG2	P55895	527 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF92	Q03936	586 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PDCD1	Q15116	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028		Q6YL49	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	KRT77	Q7Z794	578 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MYDGF	Q969H8	173 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM80	Q96HE8	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	COPS4	Q9BT78	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ABHD6	Q9BV23	337 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	COPS3	Q9UNS2	423 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028		A6NLC8	198 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	XRCC2	O43543	280 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	H2BFM	P0C1H6	154 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC159	P0C7I6	412 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC2A1	P11166	492 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MYL12A	P19105	171 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ALOX5AP	P20292	161 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	OMG	P23515	440 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	DCK	P27707	260 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	HSD11B1	P28845	292 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	DDOST	P39656	456 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC15A1	P46059	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	WDFY2	Q96P53	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	SP140L	Q9H930	580 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF878	C9JN71	531 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMD9	O00233	223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFA7	O95182	113 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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