RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CX3CR1P49238 355 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 IL5RAQ01344 420 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PRDX4Q13162 271 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 MALSU1Q96EH3 234 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 YY1AP1Q9H869 796 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CMTM6Q9NX76 183 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 LYSTQ99698 3801 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM210A6NLX4 147 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DIRAS1O95057 198 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CLIC3O95833 236 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ALDOBP05062 364 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DCTDP32321 178 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CAPZA1P52907 286 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 METTL21CQ5VZV1 264 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FAM57BQ71RH2 274 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR52J3Q8NH60 311 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 SDSLQ96GA7 329 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 RNF170Q96K19 258 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FUZQ9BT04 418 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF878C9JN71 531 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ARG1P05089 322 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF273Q14593 569 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CASC10Q5T4H9 136 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 GID8Q9NWU2 228 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 USE1Q9NZ43 259 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 LRP12Q9Y561 859 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JND7 137 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPH5 198 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ODF3BA8MYP8 253 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 LMO1P25800 156 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KLF10Q13118 480 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL22Q53GT1 634 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00471Q8N535 108 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF511Q8NB15 262 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T27Q8NH04 317 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PIGCQ92535 297 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPE2 198 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PR64 198 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PRV1 198 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 IDH3BO43837 385 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 RHCEP18577 417 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ACKR3P25106 362 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ENTPD1P49961 510 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DYNLT3P51808 116 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 LIPEQ05469 1076 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DMRTC1Q5HYR2 192 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CD177Q8N6Q3 437 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ASCL2Q99929 193 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 BRD7Q9NPI1 651 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS12A0PJE2 317 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 GSTA4O15217 222 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CST4P01036 141 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 HSD11B1P28845 292 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T4Q8NH00 348 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 TFAP2CQ92754 450 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HOXD12-201ENST00000404162 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf98A8MV24 154 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD12-201ENST00000404162 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD12-201ENST00000404162 SLC15A1P46059 708 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD12-201ENST00000404162 GPM6AP51674 278 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD12-201ENST00000404162 DLX6P56179 175 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms