RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395727.6

PTPN20-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN20, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN20-208	ENST00000395727	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC6A7	Q99884	636 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPN20-208	ENST00000395727	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPN20-208	ENST00000395727	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPN20-208	ENST00000395727	CLN8	Q9UBY8	286 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A0U1RQV5	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	OOEP	A6NGQ2	149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM210	A6NLX4	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	SRRM5	B3KS81	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727		H3BN98	237 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	GYG2	O15488	501 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	GYPB	P06028	91 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	LYN	P07948	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	HKR1	P10072	659 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	CLU	P10909	449 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ATP6V1B1	P15313	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PRTN3	P24158	256 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	HSD11B1	P28845	292 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	MTNR1A	P48039	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	CX3CR1	P49238	355 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ACTG1	P63261	375 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	IL5RA	Q01344	420 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FLOT2	Q14254	428 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TAF13	Q15543	124 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TIGD6	Q17RP2	521 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	KLHL12	Q53G59	568 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FAHD1	Q6P587	224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	REEP6	Q96HR9	211 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	THTPA	Q9BU02	230 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TEX12	Q9BXU0	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	CENPM	Q9NSP4	180 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF69	Q9UC07	566 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	POMP	Q9Y244	141 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	C5orf63	A6NC05	138 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM183A	A6NL82	134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF879	B4DU55	563 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	P2RY10	O00398	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	GNGT2	O14610	69 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FKBP6	O75344	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	E2F6	O75461	281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	CST4	P01036	141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	IGLV3-1	P01715	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	H2BFM	P0C1H6	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	MMP9	P14780	707 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ALOX5AP	P20292	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PRKX	P51817	358 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ESRRG	P62508	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	CBX1	P83916	185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	GINS1	Q14691	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM201A	Q5SY85	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	WDR82	Q6UXN9	313 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727		Q6ZSR3	168 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	WDR86	Q86TI4	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM86B	Q8N661	226 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	OR8S1	Q8NH09	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN20-208	ENST00000395727	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms