RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RREB1Q92766 1687 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB6O95139 128 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB25P24278 435 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF787Q6DD87 383 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC22Q8N966 263 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 NUBPLQ8TB37 319 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM10O14672 748 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR5AP2Q8NGF4 316 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A7Q92504 469 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MCHR2Q969V1 340 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC1BQ9P126 229 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MTFP1Q9UDX5 166 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFB3P59826 476 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 VASH2Q86V25 355 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFCQ8NFQ6 507 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR52N4Q8NGI2 321 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FN3KRPQ9HA64 309 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TUBAL3A6NHL2 446 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 GPR37O15354 613 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MOB1BQ7L9L4 216 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 DCTN6O00399 190 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF32P17041 273 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PTGFRP43088 359 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1CAP62136 330 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ERGIC1Q969X5 290 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FPR2P25090 351 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SSX1Q16384 188 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 K7EQS6 105 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ST8SIA5O15466 376 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L11O43521 198 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42EP2O14613 210 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 AKR7A2O43488 359 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 AQP8O94778 261 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 AVPR2P30518 371 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 RAG2P55895 527 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR10D3Q8NH80 312 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OCIAD1Q9NX40 245 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 AQP7P3A6NL99 342 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MEOX1P50221 254 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TLE1Q04724 770 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 BTNL8Q6UX41 500 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 RRASP10301 218 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CTLA4P16410 223 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 GNB2P62879 340 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 STRCQ7RTU9 1775 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PLPP3O14495 311 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO17Q96EF6 278 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SPRY3O43610 288 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS23O95084 383 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SPEM2Q0P670 501 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FOXC1Q12948 553 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CDONQ4KMG0 1287 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T2Q6IF00 324 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 BCORQ6W2J9 1755 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CYC1P08574 325 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SULT1A3P0DMM9 295 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SULT1A4P0DMN0 295 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF90Q03938 601 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PRDX4Q13162 271 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR13G1Q8NGZ3 307 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 HES7Q9BYE0 225 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM231Q9H6L2 316 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FAM96BQ9Y3D0 163 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 NINQ8N4C6 2090 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 RFPL4AA6NLU0 287 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM77I1YAP6 450 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF774Q6NX45 483 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR5B3Q8NH48 314 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TVP23CQ96ET8 276 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM7Q9BQ49 75 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SARGQ9BW04 601 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB3O43676 98 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 UBAC2Q8NBM4 344 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR8D4Q8NGM9 314 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR5M8Q8NGP6 311 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 H3BP45 60 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TGOLN2O43493 480 aa18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms