RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1G2O95670 118 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GRPP07492 148 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MYL12AP19105 171 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FPR2P25090 351 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DCKP27707 260 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GNALP38405 381 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 VHLP40337 213 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GSK3AP49840 483 aa6.39□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ8Q15842 424 aa6.39□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.39□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 NUP50Q9UKX7 468 aa6.39□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.38□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.38□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.37□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 J3QRE1 110 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD9O00233 223 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA2O43678 99 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 LHBP01229 141 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 IGHA1P01876 353 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GYPAP02724 150 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC159P0C7I6 412 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 EGR1P18146 543 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP1P23763 118 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MAP2K3P46734 347 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ISL1P61371 349 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PRDX4Q13162 271 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GALEQ14376 348 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 WDR82Q6UXN9 313 aa6.37□□□□□ -1.39
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