RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 SNTNA6NMZ2 147 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SRRM5B3KS81 715 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF732B4DXR9 585 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 J3QLI3 93 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FCN3O75636 299 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA2P01563 188 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF12P17014 697 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GMFBP60983 142 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GNB2P62879 340 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PAX2Q02962 417 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CEACAM21Q3KPI0 293 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FAM76BQ5HYJ3 339 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB37Q5TC79 503 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM42Q69YG0 159 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DOK3Q7L591 496 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PACRGLQ8N7B6 248 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CNIH3Q8TBE1 160 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CYGBQ8WWM9 190 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 Q96MT0 163 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF649Q9BS31 505 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SMURF1Q9HCE7 757 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 INSIG2Q9Y5U4 225 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ATRQ13535 2644 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GW55 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 AKR7A2O43488 359 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM20O43506 726 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RHBDL1O75783 438 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NRASP01111 189 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 IGHA1P01876 353 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GATA3P23771 443 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CFHR2P36980 270 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GNG3P63215 75 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CLVS2Q5SYC1 327 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 C1QL2Q7Z5L3 287 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RDH10Q8IZV5 341 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FGFRL1Q8N441 504 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ITFG2Q969R8 447 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 C4orf36Q96KX1 117 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MDFIQ99750 246 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ALG8Q9BVK2 526 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR51I2Q9H344 312 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf69Q9H7B7 122 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DUX4Q9UBX2 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CLN8Q9UBY8 286 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa12.43□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DNHD1Q96M86 4753 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GVI7 797 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 C22orf46C9J442 243 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 J3QLW9 94 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SYT7O43581 403 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TFF1P04155 84 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF19P17023 458 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 AMY2BP19961 511 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CPT2P23786 658 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GALEQ14376 348 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 KCNJ8Q15842 424 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR5A2Q8NGI9 324 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PELI1Q96FA3 418 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TECTBQ96PL2 329 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RASSF4Q9H2L5 321 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf4Q9NR00 106 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FRRS1LQ9P0K9 344 aa12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR5B21A6NL26 309 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FSHBP01225 129 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 HTR1AP08908 422 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ACTA2P62736 377 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ACTG2P63267 376 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RAB40BQ12829 278 aa12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms