RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGMQ9H3S5 423 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR31O00270 319 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LOXL4Q96JB6 756 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIP11Q15643 1979 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP92A6NM28 416 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 AQP8O94778 261 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL16Q0P5N6 197 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf90Q96M02 699 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GNB4Q9HAV0 340 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXS1O43638 330 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LYZL6O75951 148 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC3BP05452 202 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R45P59539 299 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDX4Q13162 271 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MRGPREQ86SM8 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PLXNB2O15031 1838 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SSSCA1O60232 199 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GREM1O60565 184 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CA6P23280 308 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NPBWR1P48145 328 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5B21A6NL26 309 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GP1BAP07359 652 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BAK1Q16611 211 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLN5O75503 358 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 XAF1Q6GPH4 301 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB10Q8WXI3 467 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GPANK1O95872 356 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-ND4LP03901 98 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PR80 420 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT19A8MXV4 375 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYBB2P43320 205 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ISXQ2M1V0 245 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DNPH1O43598 174 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NGFP01138 241 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB4AP20338 218 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF10Q5QP82 559 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM122BQ7Z309 247 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SKP2Q13309 424 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 AK3Q9UIJ7 227 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CSN1S1P47710 185 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM186AA6NE01 2351 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 M6PRP20645 277 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1CBP62140 327 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCA2AQ02747 115 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BTN1A1Q13410 526 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00303Q3SY05 128 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HRKO00198 91 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MBP02144 154 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10J4P0C629 311 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GDF15Q99988 308 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC13O75165 2243 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DTYMKP23919 212 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ADIRFQ15847 76 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 HFEQ30201 348 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 APH1BQ8WW43 257 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A7Q92504 469 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms