RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 RBP2P50120 134 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 PLAC9Q5JTB6 97 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 OR51S1Q8NGJ8 323 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 TM2D1Q9BX74 207 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 AHRRA9YTQ3 701 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINA2P20848 420 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 APLNRP35414 380 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MALLQ13021 153 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 RTN4RL2Q86UN3 420 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf106Q8NAJ2 232 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR51T1Q8NGJ9 327 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR10K1Q8NGX5 313 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GINS4Q9BRT9 223 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM225BP0DP42 221 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM50BP56557 158 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 METTL11BQ5VVY1 283 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MDP1Q86V88 176 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 BEST4Q8NFU0 473 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SLC7A11Q9UPY5 501 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ACACAQ13085 2346 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SSX5O60225 188 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV1-2P23083 117 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 FUT6P51993 359 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GNG2P59768 71 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 TGFBR3Q03167 851 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MAB21L1Q13394 359 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 PLCXD3Q63HM9 321 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MOB3CQ70IA8 216 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 PIGCQ92535 297 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 KCNK7Q9Y2U2 307 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MFNGO00587 321 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR2A2Q6IF42 318 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR56B2PQ8NGI1 322 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 METTL9Q9H1A3 318 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 IFT46Q9NQC8 304 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 M0QYG6 137 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 IL5P05113 134 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 RAD52P43351 418 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MEF2DQ14814 521 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ASCL4Q6XD76 172 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZT83 130 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR11H7Q8NGC8 314 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR6K3Q8NGY3 331 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A3Q96HJ5 214 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MED30Q96HR3 178 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF75AQ96N20 296 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OPA3Q9H6K4 179 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 HPXP02790 462 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 CPT2P23786 658 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ATP1B3P54709 279 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 NOXA1Q86UR1 476 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC36Q8IYA8 594 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 STARD10Q9Y365 291 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 DOCK7Q96N67 2140 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 AMY2AP04746 511 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF735P0CB33 412 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GVQW1Q8N7I0 195 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 OR4S1Q8NGB4 309 aa23.16■■□□□ 1.3
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HOXD8-201ENST00000313173 ANAPC10Q9UM13 185 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 CACNA1GO43497 2377 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SSNA1O43805 119 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 NGFP01138 241 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GSTT2P0CG29 244 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A7Q8NEW0 376 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 DKK4Q9UBT3 224 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 LHX6Q9UPM6 363 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 K7EM74 188 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ANGPTL7O43827 346 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 RAD51DO75771 328 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SULT1A3P0DMM9 295 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SULT1A4P0DMN0 295 aa23.15■■□□□ 1.3
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