RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GUH1 482 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 C5orf67F2Z3F1 127 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 AQP7O14520 342 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KCNAB3O43448 404 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 IL2RAP01589 272 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CRYAAP02489 173 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 HNF1AP20823 631 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 C21orf58P58505 322 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 HES1Q14469 280 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ADIRFQ15847 76 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CDONQ4KMG0 1287 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 BAP18Q8IXM2 172 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 EXD3Q8N9H8 876 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ABHD3Q8WU67 409 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KIF25Q9UIL4 384 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 V9GYH0 126 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PSME4Q14997 1843 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A20A6NK97 555 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR4C45A6NMZ5 311 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 M0R1B8 84 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 YKT6O15498 198 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ONECUT2O95948 504 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ADRB1P08588 477 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PTGFRP43088 359 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CSRP3P50461 194 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A1P53007 311 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PRDX4Q13162 271 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 GAB4Q2WGN9 574 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 C4orf17Q53FE4 359 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PLA1AQ53H76 456 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OSR2Q8N2R0 312 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 NECAP1Q8NC96 275 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR4A16Q8NH70 328 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR1F12Q8NHA8 337 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TVP23CQ96ET8 276 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 MAP6Q96JE9 813 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ARV1Q9H2C2 271 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 FREM3P0C091 2139 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SPRY3O43610 288 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 GDF9O60383 454 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CDC14BO60729 498 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 NDUFB6O95139 128 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 BMP5P22003 454 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 FCARP24071 287 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CHATP28329 748 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DS4P43632 304 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 LIMK1P53667 647 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CRYBA2P53672 197 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DS1Q14954 304 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TGIF1Q15583 401 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 TEX261Q6UWH6 196 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 SHISA5Q8N114 240 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 GALNT16Q8N428 558 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR10V1Q8NGI7 309 aa4.9□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR10Z1Q8NGY1 313 aa4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms