RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 PMPCAQ10713 525 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 KCNJ8Q15842 424 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CDNFQ49AH0 187 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ACTBL2Q562R1 376 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR2A2Q6IF42 318 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 NOXA1Q86UR1 476 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 COMMD2Q86X83 199 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SPICQ8N5J4 248 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ABHD3Q8WU67 409 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC107Q8WV48 283 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PIGTQ969N2 578 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 LYZL4Q96KX0 146 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 TM2D1Q9BX74 207 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 WNT5BQ9H1J7 359 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR51J1Q9H342 316 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CALHM2Q9HA72 323 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 NUDT15Q9NV35 164 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FAM172BPA6NC97 362 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FAM166BA8MTA8 275 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 DISC1C4P0D8 188 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 LCATP04180 440 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 HCKP08631 526 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR3A2P47893 321 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 RBP2P50120 134 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 EFNB2P52799 333 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 MALLQ13021 153 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 TNK1Q13470 666 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR8B8Q15620 311 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 C3AR1Q16581 482 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFA5Q16718 116 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 AWAT2Q6E213 333 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 NAA40Q86UY6 237 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FJX1Q86VR8 437 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FTMTQ8N4E7 242 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 DTX3Q8N9I9 347 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PXT1Q8NFP0 134 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 WNT2BQ93097 391 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 REEP6Q96HR9 211 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PRRT1Q99946 306 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 RHOFQ9HBH0 211 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 IL36GQ9NZH8 169 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 TINAGQ9UJW2 476 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FREM3P0C091 2139 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 MED12Q93074 2177 aa9.26□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0B4J293 547 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SLC22A20A6NK97 555 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 POM121CA8CG34 1229 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SERPINE3A8MV23 424 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 GMDSO60547 372 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 LMX1BO60663 402 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 KDM4BO94953 1096 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CRHP06850 196 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CELA3AP09093 270 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 GTF2F2P13984 249 aa9.25□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PTGER4P35408 488 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms