RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHG3	P01860	377 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	IL32	P24001	234 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	HTR2C	P28335	458 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ST7L	Q8TDW4	575 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	SYNGR4	O95473	234 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	NR2C1	P13056	603 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	AGTR1	P30556	359 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481		Q6ZS92	163 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	UBB	P0CG47	229 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	CD37	P11049	281 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	CAPZA1	P52907	286 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	SORD	Q00796	357 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	FGL1	Q08830	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	SEH1L	Q96EE3	360 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	DHH	O43323	396 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	PNP	P00491	289 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4E1	P0C645	316 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	MPG	P29372	298 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ASB5	Q8WWX0	329 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-208	ENST00000638481	ACHE	P22303	614 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	EXTL1	Q92935	676 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	PTX4	Q96A99	478 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481		R4GMQ9	66 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A0D9SG52	128 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	CYB5A	P00167	134 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	AMY2A	P04746	511 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	TBR1	Q16650	682 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	NDUFA2	O43678	99 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	DOK2	O60496	412 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-208	ENST00000638481	CD74	P04233	296 aa		13.07	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms