RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 HS3ST1O14792 307 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SSX4O60224 188 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 AMY2AP04746 511 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NUDT7P0C024 238 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB25P24278 435 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PTGER1P34995 402 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PFN4Q8NHR9 129 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SLC6A7Q99884 636 aa5.55□□□□□ -1.52
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SMAD4-212ENST00000591126 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 A0A0J9YW62 118 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.55□□□□□ -1.52
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SMAD4-212ENST00000591126 FAM183AA6NL82 134 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OR2AT4A6NND4 320 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ANGPTL7O43827 346 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
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SMAD4-212ENST00000591126 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OR2T2Q6IF00 324 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SPARTQ8N0X7 666 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.55□□□□□ -1.52
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SMAD4-212ENST00000591126 SCMH1Q96GD3 660 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ASB1Q9Y576 335 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MYO7AQ13402 2215 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OOEPA6NGQ2 149 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 H7C1C5 153 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CDC14BO60729 498 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 HPGDSO60760 199 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PTP4A3O75365 173 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MDP1Q86V88 176 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MZB1Q8WU39 189 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NUDT8Q8WV74 236 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF75AQ96N20 296 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MUS81Q96NY9 551 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NTN4Q9HB63 628 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 B4DSR2 109 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 J3QLI3 93 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SOX15O60248 233 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IGHG3P01860 377 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IGKV3-11P04433 115 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PF4V1P10720 104 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GCAP28676 217 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OR10A3P58181 314 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CDK5R2Q13319 367 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IL13RA2Q14627 380 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MPPED2Q15777 294 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 COX15Q7KZN9 410 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LGI3Q8N145 548 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 BIN3Q9NQY0 253 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 EHFQ9NZC4 300 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PATJQ8NI35 1801 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 APOL3O95236 402 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TNFRSF1BP20333 461 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CD40P25942 277 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 EVX1P49640 407 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PPP5CP53041 499 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PMP22Q01453 160 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF626Q68DY1 528 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.54□□□□□ -1.52
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