RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CD40P25942 277 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 S100A5P33763 92 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PSMB10P40306 273 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 KIR2DL3P43628 341 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 BMXP51813 675 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1CBP62140 327 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FABP5Q01469 135 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NAAAQ02083 359 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RIN1Q13671 783 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GPR176Q14439 515 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR8B8Q15620 311 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TAB1Q15750 504 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CTF1Q16619 201 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM203Q969S6 136 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 HAVCR1Q96D42 359 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DERL3Q96Q80 235 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 S100A13Q99584 98 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MMP27Q9H306 513 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CMAHPQ9Y471 501 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CADP27708 2225 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ABCA4P78363 2273 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR5B21A6NL26 309 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NOTOA8MTQ0 251 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IFNL4K9M1U5 179 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 M0R1B8 84 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY10O00398 339 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNHIT1O43257 154 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 AGFG2O95081 481 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PNPP00491 289 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LALBAP00709 142 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV3-1P01715 115 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CECR9P0C854 216 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PATE4P0C8F1 98 aa6.31□□□□□ -1.4
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF83P51522 516 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FUT6P51993 359 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ARL6IP1Q15041 203 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 C22orf42Q6IC83 251 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.31□□□□□ -1.4
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SMAD4-210ENST00000590061 FGGYQ96C11 551 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF75AQ96N20 296 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR14A2Q96R54 314 aa6.31□□□□□ -1.4
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SMAD4-210ENST00000590061 CHST5Q9GZS9 411 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR51E2Q9H255 320 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NOX4Q9NPH5 578 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM100Q9NV29 134 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ETV7Q9Y603 341 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 V9GY05 133 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 V9GYS6 101 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 A0A075B6Q4 140 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.3□□□□□ -1.4
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