RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FAM3AP98173 230 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR8B8Q15620 311 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA5Q16718 116 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GPR107Q5VW38 600 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 FAHD1Q6P587 224 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KLBQ86Z14 1044 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CBR4Q8N4T8 237 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 RDH12Q96NR8 316 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 OR8B2Q96RD0 313 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TEAD3Q99594 435 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MRI1Q9BV20 369 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MARCH7Q9H992 704 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MMP26Q9NRE1 261 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 RNF7Q9UBF6 113 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 AUP1Q9Y679 476 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ANK2Q01484 3957 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GWJ7 208 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PRKYO43930 277 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CPT2P23786 658 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GSK3AP49840 483 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF154Q13106 437 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ8Q15842 424 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF404Q494X3 552 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD2Q86X83 199 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PARP8Q8N3A8 854 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 FTMTQ8N4E7 242 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 Q8TCH9 128 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 S100ZQ8WXG8 99 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SPSB4Q96A44 273 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 MICU1Q9BPX6 476 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 RGCCQ9H4X1 137 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 NIPAL2Q9H841 368 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 CLN8Q9UBY8 286 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0A6YYJ9 748 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS8O00214 317 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GNAO1P09471 354 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ALOX5APP20292 161 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A5P22732 501 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CD80P33681 288 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PITPNBP48739 271 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GABARAPL2P60520 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IL5RAQ01344 420 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PIGCQ92535 297 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TECTBQ96PL2 329 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 JMJD8Q96S16 334 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.3 ms