RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559253.1

IPO4-208, Transcript of importin 4, human

TSL 4

Gene IPO4, Length 579 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IPO4-208	ENST00000559253	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.63	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.63	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253		R4GMQ9	66 aa		13.63	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	DHRS3	O75911	302 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	KRT8	P05787	483 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	LIPF	P07098	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	MICB	Q29980	383 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	EME1	Q96AY2	570 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.62	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	PSMD9	O00233	223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	TTR	P02766	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	FPR2	P25090	351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	GNG3	P63215	75 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ACTC1	P68032	377 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ACTA1	P68133	377 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OCLN	Q16625	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.61	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	GPR37	O15354	613 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	MPZL2	O60487	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	CCL1	P22362	96 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	CD80	P33681	288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ATP6V1E1	P36543	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	MTNR1A	P48039	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	HILS1	P60008	231 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	TMEM42	Q69YG0	159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	PIGC	Q92535	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.6	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	DLGAP1	O14490	977 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	CDIPT	O14735	213 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ADAM20	O43506	726 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	BPIFB3	P59826	476 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	RNF170	Q96K19	258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253		V9GYS6	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
IPO4-208	ENST00000559253		A0A1B0GTI1	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IPO4-208	ENST00000559253		J3QRE1	110 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IPO4-208	ENST00000559253	ISL1	P61371	349 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IPO4-208	ENST00000559253	CSNK2B	P67870	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms