RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HERC1	Q15751	4861 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A087WUJ7	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PS18	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GSTA1	P08263	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LAMP1	P11279	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SDC1	P18827	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	IMPDH1	P20839	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PMEL	P40967	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MAGEA4	P43358	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HTR5A	P47898	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GSK3B	P49841	420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	INSL3	P51460	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF75D	P51815	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BID	P55957	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PCBD1	P61457	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR8B8	Q15620	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PNKD	Q8N490	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		M0R1W7	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR6A2	O95222	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HPR	P00739	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	INHBA	P08476	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF32	P17041	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CBL	P22681	906 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CDA	P32320	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB25	P57735	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NAA20	P61599	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	BLCAP	P62952	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PSG4	Q00888	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	KLRD1	Q13241	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SELPLG	Q14242	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		Q8N7P7	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	P2RX4	Q99571	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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