RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 ZFP90Q8TF47 636 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SMPDL3AQ92484 453 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 COX14Q96I36 57 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 Q96MT0 163 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 OR52B2Q96RD2 323 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 RNF2Q99496 336 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CCL19Q99731 98 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 EBF4Q9BQW3 602 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 THTPAQ9BU02 230 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC32Q9BV29 185 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 TPPP3Q9BW30 176 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 PKIBQ9C010 78 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 TRABDQ9H4I3 376 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 NT5DC2Q9H857 520 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 MYNNQ9NPC7 610 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM138Q9NPI0 162 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DMAC2Q9NW81 257 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SMPXQ9UHP9 88 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 STUB1Q9UNE7 303 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 HSPB11Q9Y547 144 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1B0GW55 424 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 MGAT4DA6NG13 374 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 URADA6NGE7 173 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 AIPO00170 330 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 BHLHE40O14503 412 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 VAPBO95292 243 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 HPP00738 406 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 TGFAP01135 160 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 IFNA17P01571 189 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SCGB1A1P11684 91 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ETS1P14921 441 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SPNP16150 400 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 MSR1P21757 451 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 UQCRC2P22695 453 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SLC6A1P30531 599 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 KCNJ1P48048 391 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 KCNJ3P48549 501 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 RAB5CP51148 216 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ERVS71-1P61550 626 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 IL5RAQ01344 420 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 PRKCDQ05655 676 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 BCL2L1Q07817 233 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SLC17A1Q14916 467 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ARL6IP1Q15041 203 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SLC9A3R2Q15599 337 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 OR8G1Q15617 311 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 LEMD1Q68G75 181 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 TEX38Q6PEX7 206 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF613Q6PF04 617 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 PLET1Q6UQ28 207 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CES3Q6UWW8 571 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 OOSP2Q86WS3 158 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 C3orf56Q8N813 242 aa4.05□□□□□ -1.76
ATXN3-218ENST00000553309 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms