RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ADI1Q9BV57 179 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GVI7 797 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 CLIC3O95833 236 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PNPP00491 289 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 TTRP02766 147 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DCTDP32321 178 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PMELP40967 661 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 GPM6AP51674 278 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 CSNK2BP67870 215 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF91Q05481 1191 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LIPNQ5VXI9 398 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 MOB3CQ70IA8 216 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC29Q8WV35 223 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LGALS12Q96DT0 336 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF170Q96K19 258 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 RDH12Q96NR8 316 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCB9Q9NP78 766 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 C8orf4Q9NR00 106 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0G2JMP0 313 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0X1KG70 313 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GWJ7 208 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 J3QLW9 94 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 CDIPTO14735 213 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SYT7O43581 403 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 FOXH1O75593 365 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SULT1C4O75897 302 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DHRS3O75911 302 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 IFNA2P01563 188 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF19P17023 458 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF85Q03923 595 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SETD9Q8NE22 299 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4M2Q8NGB6 313 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8TCH9 128 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf159Q96HA4 380 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 OR8B2Q96RD0 313 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM160Q9NX00 188 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 MIOXQ9UGB7 285 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 A6NIN4 97 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF732B4DXR9 585 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LGALS8O00214 317 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC16A6O15403 523 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 CST4P01036 141 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 HTR1AP08908 422 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM157CP0CG43 387 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 PITPNBP48739 271 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 OR12D2P58182 307 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTA2P62736 377 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 GNB2P62879 340 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTG2P63267 376 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF154Q13106 437 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNJ8Q15842 424 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF404Q494X3 552 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 TTC23Q5W5X9 447 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 DOK3Q7L591 496 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR86Q86TI4 376 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms