RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528150.1

USP33-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, human

TSL 3

Gene USP33, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP33-215	ENST00000528150	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PSMD9	O00233	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	HTR1F	P30939	366 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PSMB10	P40306	273 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GNG3	P63215	75 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PAX8	Q06710	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150		R4GMQ9	66 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	HAX1	O00165	279 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GPR37	O15354	613 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GYPA	P02724	150 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CFHR2	P36980	270 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	BPIFB3	P59826	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150		M0R129	80 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CDIPT	O14735	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	NDUFB3	O43676	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	DHRS3	O75911	302 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ANOS1	P23352	680 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ALDH3A2	P51648	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ACTC1	P68032	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ACTA1	P68133	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	STMN2	Q93045	179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150		A0A1B0GVI7	797 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	VENTX	O95231	258 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FSHB	P01225	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LHB	P01229	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ACKR3	P25106	362 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	EPHA2	P29317	976 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GPM6A	P51674	278 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CSNK2B	P67870	215 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	EFNB1	P98172	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	DOK3	Q7L591	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MED30	Q96HR3	178 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LYZL4	Q96KX0	146 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TBX5	Q99593	518 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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