RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511459.1

APBB3-217, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family B member 3, human

TSL 4

Gene APBB3, Length 547 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBB3-217	ENST00000511459	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	GPER1	Q99527	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.13	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	IGFBP2	P18065	325 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ADRA2C	P18825	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CFP	P27918	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	THBS2	P35442	1172 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	GLRX	P35754	106 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	NR4A2	P43354	598 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ART1	P52961	327 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	OR8B8	Q15620	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	FAM189A2	Q15884	450 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	S100A13	Q99584	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.12	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ISPD	A4D126	451 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459		J3QKU1	62 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SIAH2	O43255	324 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ALX3	O95076	343 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ALDOB	P05062	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CD3E	P07766	207 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	RAC2	P15153	192 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	FAH	P16930	419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ELK1	P19419	428 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	PRKACB	P22694	351 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	MPV17	P39210	176 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	EVX1	P49640	407 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	PSG7	Q13046	419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	UPK1B	O75841	260 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	SCGN	O76038	276 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	PAH	P00439	452 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	UBB	P0CG47	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	ARSB	P15848	533 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	PITPNB	P48739	271 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	FABP6	P51161	128 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	RIN1	Q13671	783 aa		10.1	□□□□□ -0.79
APBB3-217	ENST00000511459	P2RY14	Q15391	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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