RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 BEX1Q9HBH7 125 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PP11 408 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM172BPA6NC97 362 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.36□□□□□ -0.91
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