RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	MAP2K3	P46734	347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CSNK2B	P67870	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TMED1	Q13445	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC29	Q8WV35	223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SLC6A7	Q99884	636 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327		E9PQ18	207 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	EBAG9	O00559	213 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	EI24	O14681	340 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ADAM20	O43506	726 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TTR	P02766	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FPR2	P25090	351 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CDC42	P60953	191 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CD276	Q5ZPR3	534 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RFK	Q969G6	155 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TECTB	Q96PL2	329 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327		R4GMQ9	66 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C22orf46	C9J442	243 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	CDIPT	O14735	213 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	DHRS3	O75911	302 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	GYPA	P02724	150 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	MICB	Q29980	383 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327		Q6ZSR3	168 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	COMMD2	Q86X83	199 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	PIGC	Q92535	297 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	EME1	Q96AY2	570 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	PLAT	P00750	562 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	KRT8	P05787	483 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	GNG3	P63215	75 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	STUM	Q69YW2	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	RNF170	Q96K19	258 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	TMPRSS2	O15393	492 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RBM28-208	ENST00000495327	FCN3	O75636	299 aa		11.06	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms