RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K3Q96R72 315 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ARV1Q9H2C2 271 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR51B5Q9H339 312 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf50Q9HD87 102 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PLIN3O60664 434 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB7O75635 380 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CCNE2O96020 404 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF806P0C7X5 589 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CXCR1P25024 350 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 DUPD1Q68J44 220 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZSR6 202 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ERO1BQ86YB8 467 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 NECAP1Q8NC96 275 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GHSRQ92847 366 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 NEURL3Q96EH8 262 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MSANTD3Q96H12 275 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 VCX3AQ9NNX9 186 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OPN4Q9UHM6 478 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 V9GYY9 64 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TNS2Q63HR2 1409 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RFXANKO14593 260 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PTTG1O95997 202 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 HTR2CP28335 458 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MTPNP58546 118 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 INCA1Q0VD86 236 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TEX30Q5JUR7 227 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf183Q5T699 404 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PID1Q7Z2X4 250 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR51A7Q8NH64 312 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR1L1Q8NH94 360 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf50Q8WW18 174 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ING5Q8WYH8 240 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR10C1Q96KK4 312 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GABRG3Q99928 467 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RNF5Q99942 180 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM150BA6NC51 233 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD11O00231 422 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ALOX12BO75342 701 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CCNKO75909 580 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SMC2O95347 1197 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 P01737 135 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DQB1P01920 261 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CCNOP22674 350 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TMED1Q13445 227 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 COX19Q49B96 90 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf99Q4VX62 202 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 DRAM1Q8N682 238 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PRO0461Q9UI25 63 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf66A4D0T2 115 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SLIT3O75094 1523 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AL1P0C617 328 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GNRHRP30968 328 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00315P59091 139 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2R1Q13018 1463 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf60Q96EN9 201 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SNF8Q96H20 258 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 Q96MT0 163 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 JCADQ9P266 1359 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CENPBD1B2RD01 187 aa4.58□□□□□ -1.68
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