RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LHBP01229 141 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TTRP02766 147 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ACKR3P25106 362 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PMELP40967 661 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ACTA2P62736 377 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GNB2P62879 340 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ACTG2P63267 376 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ZNF154Q13106 437 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MICBQ29980 383 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LIPNQ5VXI9 398 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DOK3Q7L591 496 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 NANPQ8TBE9 248 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 C10orf35Q96D05 121 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LYZL4Q96KX0 146 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TECTBQ96PL2 329 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SLC29A1Q99808 456 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ADI1Q9BV57 179 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GPR84Q9NQS5 396 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 STAB1Q9NY15 2570 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 A0A0A6YYJ9 748 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DAPL1A0PJW8 107 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DLGAP1O14490 977 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ENTPD6O75354 484 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PSMB10P40306 273 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GNG3P63215 75 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LCN2P80188 198 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RAB40BQ12829 278 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 KLHL22Q53GT1 634 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TTC23Q5W5X9 447 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CD276Q5ZPR3 534 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LPCAT4Q643R3 524 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZSR3 168 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SETD9Q8NE22 299 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RNFT2Q96EX2 444 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RNF170Q96K19 258 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DMRTB1Q96MA1 342 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MBOAT4Q96T53 435 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MRI1Q9BV20 369 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 VCXQ9H320 206 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 C7orf69Q9H7B7 122 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CLN8Q9UBY8 286 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 IRGMA1A4Y4 181 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PRR32B1ATL7 298 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GPR37O15354 613 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 NRASP01111 189 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LIPFP07098 398 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GABRB1P18505 474 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CCL1P22362 96 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PITPNBP48739 271 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 IL18R1Q13478 541 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CDONQ4KMG0 1287 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 WDR82Q6UXN9 313 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CATSPERDQ86XM0 798 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PHC2Q8IXK0 858 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ENTHD1Q8IYW4 607 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 UBE2FQ969M7 185 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TBX5Q99593 518 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 GNG8Q9UK08 70 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SLC22A13Q9Y226 551 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 V9GYS6 101 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GVI7 797 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SRRM5B3KS81 715 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 J3QRE1 110 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CDIPTO14735 213 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms