RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN17P56750 224 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC35B1P78383 322 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNJ8Q15842 424 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM107Q6UX40 140 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6ZR03 302 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF573Q86YE8 665 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 DRAM1Q8N682 238 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF614Q8N883 585 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OCC1Q8TAD7 63 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ACTL9Q8TC94 416 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ST8SIA1Q92185 356 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ARPC1AQ92747 370 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ESAMQ96AP7 390 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OR4C12Q96R67 309 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GWJ7 208 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 XKRY2A2RUG3 117 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 F8WDY8 70 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 L7N2F9 121 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 M0QX08 132 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 GLCEO94923 617 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 IFNA10P01566 189 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 HLA-DQA2P01906 255 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 APOC2P02655 101 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 GYPAP02724 150 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 LCATP04180 440 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT8P05787 483 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS2P07478 247 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CDKN2DP55273 166 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PHEXP78562 749 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF616Q08AN1 781 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 MAB21L1Q13394 359 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8B8Q15620 311 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SSX2Q16385 188 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PDK4Q16654 411 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 MMGT1Q8N4V1 131 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM234Q8WY98 164 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 MCHR2Q969V1 340 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SERPINB12Q96P63 405 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 MS4A10Q96PG2 267 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 GIN1Q9NXP7 522 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 GAGE12JA6NER3 117 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 E9PBE3 544 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CTDSPLO15194 276 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNK2O95069 426 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PTHP01270 115 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TPM1P09493 284 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8U9P0C7N5 309 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PGA5P0DJD9 388 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 GALP22466 123 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CALB2P22676 271 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms