RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	PP6455	Q8WZ26	134 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0B4J2A0	478 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	YKT6	O15498	198 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FPR2	P25090	351 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	STAR	P49675	285 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ARFRP1	Q13795	201 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	IER2	Q9BTL4	223 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CHST5	Q9GZS9	411 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GLS2	Q9UI32	602 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf51	A6NDU8	294 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SFT2D2	O95562	160 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A9	P48067	706 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TM2D1	Q9BX74	207 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DKKL1	Q9UK85	242 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	STMND1	H3BQB6	276 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GP1BA	P07359	652 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CCL4	P13236	92 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAH	P16930	419 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	AMY2B	P19961	511 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC18	Q8N456	261 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C10orf35	Q96D05	121 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0J9YW62	118 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		C9J4A7	227 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		G3V3Y1	287 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RAC1	P63000	192 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RNF126	Q9BV68	326 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PECR	Q9BY49	303 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RAB18	Q9NP72	206 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		M0R135	149 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	APOC1	P02654	83 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HPN	P05981	417 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CNR1	P21554	472 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MLF1	P58340	268 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R46	P59540	309 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MC2R	Q01718	297 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BTN1A1	Q13410	526 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM17	Q86X19	198 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HAS2	Q92819	552 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF799	Q96GE5	643 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CDC6	Q99741	560 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		14.83	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058		F8VVB4	439 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058		F8VWA3	439 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CA11	O75493	328 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CFI	P05156	583 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FCGR2A	P12318	317 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FAM27B	Q5VT28	67 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058		Q7L0L9	218 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO17	Q96EF6	278 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SERPINE3	A8MV23	424 aa		14.82	□□□□□ -0.04

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