RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446439.1

RPS29P28-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P28, Length 141 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P28-201ENST00000446439 CEACAM6P40199 344 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 MDH2P40926 338 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RFC3P40938 356 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SOX3P41225 446 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CSKP41240 450 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 EIF1P41567 113 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ACTR1BP42025 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CDKN2CP42773 168 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GLP1RP43220 463 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SSR2P43308 183 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 OR1E2P47887 323 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 OR3A2P47893 321 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 P2RY1P47900 373 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CSNK1A1P48729 337 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC11A1P49279 550 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SULT1A2P50226 295 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GDI2P50395 445 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ASCL1P50553 236 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 DAP3P51398 398 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 P2RX1P51575 399 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CTSCP53634 463 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CRYBA2P53672 197 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RAB38P57729 211 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 OR10A3P58181 314 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TAS2R30P59541 319 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 KIAA1024LP59773 190 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SELENOVP59797 346 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 KRTAP12-2P59991 146 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ZP1P60852 638 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RPL27P61353 136 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TBPL1P62380 186 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GRB2P62993 217 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PAFAH1B2P68402 229 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CSNK1G2P78368 415 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC35A1P78382 337 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CCL7P80098 99 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 HOXC5Q00444 222 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CDK3Q00526 305 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TLE4Q04727 773 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 BAXQ07812 192 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SPOCK1Q08629 439 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PJVKQ0ZLH3 352 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 FUT7Q11130 342 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PLA2G7Q13093 441 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PRDX4Q13162 271 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 HTR4Q13639 388 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GPR18Q14330 331 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF234Q14588 700 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF273Q14593 569 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GANABQ14697 944 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GPNMBQ14956 572 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TAF13Q15543 124 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 OR8B8Q15620 311 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SGCBQ16585 318 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ATP6V1FQ16864 119 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RTL8BQ17RB0 113 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM241Q24JQ0 296 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PCGF3Q3KNV8 242 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 C2orf76Q3KRA6 126 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 GTDC1Q4AE62 458 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 KHDC3LQ587J8 217 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SGO1Q5FBB7 561 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC25A53Q5H9E4 307 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF766Q5HY98 468 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM255AQ5JRV8 349 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ACER2Q5QJU3 275 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 VAX1Q5SQQ9 334 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 C1orf100Q5SVJ3 147 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM69Q5SWH9 247 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF684Q5T5D7 378 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 AVPI1Q5T686 147 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PRAMEF20Q5VT98 475 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 LIPNQ5VXI9 398 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 SHEQ5VZ18 495 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM268Q5VZI3 342 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM236Q5W0B7 351 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM166AQ6J272 317 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 MFSD12Q6NUT3 480 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 STEAP1BQ6NZ63 245 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 NIPAL3Q6P499 406 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 PRSS54Q6PEW0 395 aa0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPS29P28-201ENST00000446439 FIGLAQ6QHK4 219 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms