RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GALPQ9UBC7 116 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CHD4Q14839 1912 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MBD5Q9P267 1494 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR2W5A6NFC9 320 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DPRXA6NFQ7 191 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR11H12B2RN74 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A4P12235 298 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CTSEP14091 401 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 UCP2P55851 309 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5J2P56134 94 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LCN15Q6UWW0 184 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR11H1Q8NG94 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR11H2Q8NH07 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4F5Q8NH21 305 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GHSRQ92847 366 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 ESAMQ96AP7 390 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4F4Q96R69 305 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IL36AQ9UHA7 158 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NSG2Q9Y328 171 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FLT4P35916 1363 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DQB1P01920 261 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB7P26010 798 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ID4P47928 161 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LCN2P80188 198 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RUNX2Q13950 521 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PMVKQ15126 192 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GAB4Q2WGN9 574 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PARM1Q6UWI2 310 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PELI3Q8N2H9 469 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GPR148Q8TDV2 347 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PTX4Q96A99 478 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CAPNS2Q96L46 248 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS50Q9UI38 385 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DAPP1Q9UN19 280 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FZD1Q9UP38 647 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EVPLQ92817 2033 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GABRDO14764 452 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35E2BP0CK96 405 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CXCR3P49682 368 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 NSDHLQ15738 373 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CBLL1Q75N03 491 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 WDTC1Q8N5D0 677 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 C2orf50Q96LR7 162 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MRIQ9BWK5 157 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EBPLQ9BY08 206 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 KLK11Q9UBX7 282 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 MED31Q9Y3C7 131 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ARID1AO14497 2285 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PSMB11A5LHX3 300 aa5.03□□□□□ -1.6
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