RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 F5H5T6 163 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KNG1P01042 644 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 F11P03951 625 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IFNA6P05013 189 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TACSTD2P09758 323 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IL9P15248 144 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ADRA2CP18825 462 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C4orf17Q53FE4 359 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM104Q8NE00 496 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 WDR34Q96EX3 536 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 VCX2Q9H322 139 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FBXL17Q9UF56 701 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 YIPF1Q9Y548 306 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CDC42EP2O14613 210 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LILRA1O75019 489 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PRH1P02810 166 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KLKB1P03952 638 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IMPA1P29218 277 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PBX2P40425 430 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FAM189A2Q15884 450 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TAF9Q16594 264 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 UBE2E3Q969T4 207 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MOB3AQ96BX8 217 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RASD2Q96D21 266 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SMIM14Q96QK8 99 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KIAA1456Q9P272 454 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 DAPP1Q9UN19 280 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC17A2O00624 439 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TNFSF14O43557 240 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SYNGR4O95473 234 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KLK1P06870 262 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 P2RY1P47900 373 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HLA-DRB3P79483 266 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IL15RAQ13261 267 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 POC1AQ8NBT0 407 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SPSB4Q96A44 273 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LYSMD1Q96S90 227 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IMMP2LQ96T52 175 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MS4A8Q9BY19 250 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RBKSQ9H477 322 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PLK3Q9H4B4 646 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GPR35Q9HC97 309 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 A0A1W2PS29 197 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF264O43296 627 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FCMRO60667 390 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SFT2D2O95562 160 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CTXN2P0C2S0 81 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms